As finalidades do Centro de Bioética foram estabelecidas pela Resolução nº 260 do Cremesp, de 3 de Fevereiro de 2014. São elas:
Conjuntamente com a Câmara Técnica de Bioética do CREMESP, propor debates e difundir assuntos pertinentes à ética médica e bioética;
Atuar em conjunto com a Biblioteca 'Dr. Flamínio Fávero';
Produzir e divulgar conhecimentos em ética médica e bioética, por meio das publicações do CREMESP e outros meios de divulgação;
Implementar projetos e atividades na área da ética médica e da bioética por meio de parcerias e convênios com Universidades, Conselhos Profissionais, Sociedades de Especialidades, Fundações, Entidades e Organizações Governamentais e não Governamentais nacionais e internacionais;
Promover, participar e apoiar eventos, congressos, simpósios, seminários e cursos na área de ética médica e bioética, desde que autorizados previamente pela Diretoria do CREMESP;
Contribuir conjuntamente com a Câmara Técnica de Bioética para a elaboração, aperfeiçoamento e divulgação de diretrizes, códigos, leis, declarações e recomendações - nacionais e internacionais - na área de ética médica e bioética;
Contribuir para a educação em ética médica e bioética, colaborando com os cursos das Faculdades de Medicina e da área da saúde;
Organizar a realização de julgamentos simulados de caráter didático, autorizados previamente pela Diretoria do CREMESP;
Atuar, em conjunto com a Biblioteca Dr. Flamínio Fávero, como centro de estudos de referência em ética média e bioética, na manutenção do acervo, sob o comando do bibliotecário;
Incentivar a pesquisa nas áreas de ética médica e bioética, com oferta de bolsas para estudantes de Medicina em parcerias com as universidades, sociedades científicas e de especialidades médicas;
Atuar na capacitação das Comissões de Ética Médica e promover intercâmbio com os Comitês de Ética em Pesquisa;
Acompanhar, desenvolver estudos e reflexões, bem como opinar junto aos Conselheiros e Delegados do CREMESP de forma consubstanciada sobre as implicações éticas, jurídicas e sociais da Medicina e da Ciência.